Sacramento Kings (2011-2014)
Prima del draft NBA 2011, Thomas ha partecipato al proprio documentario pre-draft intitolato “Road To The NBA-The Isaiah Thomas Story”. Thomas è stato selezionato nel secondo turno del draft NBA 2011 con la 60esima e ultima scelta dai Sacramento Kings. Il 19 febbraio 2012, Thomas ha registrato la sua prima doppia-doppia con 23 punti e 11 assist contro i Cleveland Cavaliers.
Il 1º marzo 2012, Thomas è stato nominato il febbraio Western Conference NBA Rookie of the Month dopo una media di 12,2 punti e 4,4 assist a gara nel mese di febbraio. Nessun giocatore prima aveva vinto il premio di Rookie of the Month dopo essere stato scelto per ultimo nel draft NBA. Il 2 aprile 2012, Thomas è stato ancora una volta nominato Rookie del mese della Western Conference NBA dopo aver registrato una media di 13,6 punti e 4,9 assist a gara nel mese di marzo. Thomas è stato anche nominato nell’NBA All-Rookie Second Team e si è classificato settimo nelle votazioni per l’NBA Rookie of the Year.
Il 19 gennaio 2014, Thomas ha segnato un allora career-high di 38 punti durante una sconfitta contro gli Oklahoma City Thunder. Cinque giorni dopo, ha pareggiato questo stesso totale di punti contro gli Indiana Pacers. Il 18 marzo 2014 registrò la sua prima tripla-doppia in carriera con 24 punti, 11 assist e 10 rimbalzi in una vittoria 117-111 ai supplementari contro i Washington Wizards; dandogli la distinzione di essere il giocatore più basso ad aver mai registrato una tripla-doppia nella NBA. Durante la stagione 2013-14, Thomas si è unito a Calvin Murphy (due volte), Dana Barros, Damon Stoudamire, e Michael Adams come gli unici giocatori sotto i 6 ft (1,8 m) di altezza di media oltre 20 punti a partita e 6 assist a partita in una stagione.
Thomas fu immensamente popolare nelle sue tre stagioni a Sacramento; la sua dimostrazione di solidarietà e le sue frequenti apparizioni alle riunioni del Consiglio Comunale durante la saga del trasferimento dei Kings, in particolare, lo resero caro a molti tifosi.
Phoenix Suns (2014-2015)
Il 12 luglio 2014, Thomas fu acquistato dai Phoenix Suns in un accordo sign-and-trade che inviò anche i diritti di Alex Oriakhi ai Kings. Il 14 agosto 2014, Thomas si sottopose con successo a un’artroscopia del polso sinistro, per un infortunio subito nella stagione precedente. Fece il suo debutto per i Suns nella loro vittoriosa apertura di stagione 119-99 contro i Los Angeles Lakers, in cui registrò 23 punti, 3 assist e 1 rimbalzo. Nella successiva partita dei Suns il 31 ottobre, Thomas registrò nuovamente 23 punti in una vittoria 94-89 contro i San Antonio Spurs, unendosi a Tom Chambers, A.C. Green, e Tom Gugliotta come il quarto Sun a segnare almeno 23 punti nelle loro prime due partite con la squadra.
Dopo aver saltato otto partite con un infortunio alla caviglia, Thomas tornò in azione il 12 dicembre segnando 10 punti nella perdita 103-105 dei Suns contro i Detroit Pistons. Il 21 gennaio 2015 registrò un season-high di 27 punti dalla panchina in una vittoria 118-113 contro i Portland Trail Blazers. Il 5 febbraio, Thomas fu annunciato come concorrente dell’NBA Skills Challenge, diventando così il concorrente più basso ad aver mai partecipato all’evento.
Boston Celtics (2015-2017)
stagione 2014-15
Il 19 febbraio 2015, Thomas fu scambiato con i Boston Celtics in cambio di Marcus Thornton e una scelta del primo turno 2016. Fece il suo debutto per i Celtics tre giorni dopo in una sconfitta ai supplementari 118-111 contro i Los Angeles Lakers, segnando 21 punti dalla panchina. Il 2 marzo 2015 fu nominato Eastern Conference Player of the Week per le partite giocate da lunedì 23 febbraio a domenica 1 marzo. In seguito saltò otto partite a marzo con una contusione alla parte bassa della schiena. L’8 aprile 2015, segnò un season-high di 34 punti in una vittoria 113-103 sui Detroit Pistons. Successivamente guadagnò gli onori di Eastern Conference Player of the Week per le partite giocate da lunedì 6 aprile a domenica 12 aprile. Nella sua prima partita di playoff in carriera, il 19 aprile, Thomas ha registrato 22 punti e 10 assist in una gara 1 del primo turno persa contro i Cleveland Cavaliers. I Celtics hanno continuato a perdere contro i Cavaliers in uno sweep di quattro partite, come Thomas in media 17,5 punti e 7,0 assist nella serie. Come risultato del suo ruolo di sesto uomo sia con Phoenix che con Boston nel 2014-15, Thomas finì secondo nelle votazioni dell’NBA Sixth Man of the Year Award con 324 punti, inclusi 33 voti al primo posto.
Stagione 2015-16
Il 16 dicembre 2015, Thomas pareggiò il suo allora career high di 38 punti in una sconfitta 119-116 contro i Detroit Pistons. Il 28 gennaio 2016 fu nominato riserva della Eastern Conference All-Star per l’NBA All-Star Game 2016. Thomas divenne la più bassa scelta del draft ad essere nominata All-Star da quando il draft NBA fu ridotto a due round nel 1989. Divenne anche solo il nono giocatore sotto i 6 piedi (1,8 m) ad essere nominato All-Star, mentre legava anche Calvin Murphy come il giocatore più basso ad essere selezionato per l’All-Star Game. L’8 febbraio 2016 è stato nominato giocatore della Eastern Conference della settimana per le partite giocate da lunedì 1 febbraio a domenica 7 febbraio. Thomas guidò i Celtics a una settimana di 4-0, compresa una vittoria su strada contro i Cleveland Cavaliers, leader della Eastern Conference, mentre aveva una media di 20,3 punti (12° a est), 7,0 assist (a pari merito con il quarto nella conference) e 4,5 rimbalzi. Con i Celtics sotto 2-0 contro gli Atlanta Hawks nel primo turno dei playoff del 2016, Thomas ha segnato un allora-carriera-high 42 punti in gara 3 a Boston per sollevare i Celtics ad una vittoria 111-103. Divenne solo il nono Celtic a segnare 40 punti in una partita di playoff. Con 28 punti in gara 4, Thomas aiutò i Celtics a pareggiare la serie sul 2-2 con una vittoria ai supplementari 104-95. Tuttavia, i Celtics hanno continuato a perdere la serie 4-2.
Stagione 2016-17
Nelle prime 21 partite della stagione 2016-17, Thomas ha segnato 20 punti o più in ogni gara tranne una. Dopo essere tornato da un’assenza di quattro partite all’inizio di dicembre con uno stiramento all’inguine, Thomas ha continuato a fare grandi numeri. Il 20 dicembre, ha segnato un allora carriera-high 44 punti, tra cui 36 dopo l’intervallo, in una vittoria 112-109 overtime contro i Memphis Grizzlies. Ha anche eguagliato il suo record di carriera per i tre punti, andando 7 su 10 da fuori dall’arco. Successivamente ha guadagnato il premio di giocatore della settimana della Eastern Conference per le partite giocate da lunedì 19 a domenica 25 dicembre. Il 30 dicembre contro Miami, ha segnato 29 dei suoi 52 punti in carriera nel quarto quarto, stabilendo un record di franchigia per punti in un periodo e portando Boston a una vittoria 117-114 contro gli Heat. Thomas ha colpito sei dei suoi nove tiri da tre punti nel quarto e ha battuto il record di franchigia di 24 punti in un quarto stabilito da Larry Bird nel 1983 ed eguagliato da Todd Day nel 1995. I 52 punti di Thomas furono il quarto punteggio totale più alto nella storia dei Celtics-Bird detiene il record con 60 punti nel marzo 1985.
Il 3 gennaio 2017, Thomas ha registrato 29 punti e un career-high di 15 assist in una vittoria 115-104 contro gli Utah Jazz. Il 21 gennaio, ha avuto uno sforzo di 41 punti in una sconfitta 127-123 all’overtime contro i Portland Trail Blazers, segnando la sua 14a partita da 30 punti della stagione. Il 26 gennaio è stato nominato riserva della Eastern Conference All-Star per l’NBA All-Star Game 2017. Thomas ha avuto una media di 32,9 punti a gennaio, segnando la terza media mensile più alta nella storia della squadra – Paul Pierce ha avuto una media di 33,5 nel febbraio 2006, e Larry Bird ha avuto una media di 33,1 punti nel febbraio 1988. Il 2 febbraio è stato nominato giocatore del mese di gennaio della Eastern Conference. Ha guidato la NBA nel punteggio (32,9 ppg) e ha legato per il quinto posto a est in assist (6,9 apg) per il mese come i Celtics sono andati 10-4 per prendere il primo posto nella Atlantic Division. Il 15 febbraio ha segnato 33 punti in una vittoria 116-108 sui Philadelphia 76ers. Fu la sua 40ª partita consecutiva da 20 punti, pareggiando il record di squadra stabilito da John Havlicek durante la stagione 1971-72. Il giorno seguente, ebbe 29 punti in una sconfitta 104-103 contro i Chicago Bulls, andando 8 su 18 dal campo nella sua 41ª partita consecutiva con almeno 20 punti, battendo il record di squadra di Havlicek. Con 19 punti contro gli Atlanta Hawks il 27 febbraio, la striscia di record di franchigia di Thomas di partite consecutive da 20 punti è finita a 43. Era solo la seconda volta in questa stagione che non ha registrato almeno 20 punti in una partita. Il 12 marzo contro Chicago, Thomas ha colpito il suo 200° tiro da tre punti della stagione, diventando il terzo giocatore dei Celtics di tutti i tempi a raggiungere questo traguardo insieme ad Antoine Walker e Paul Pierce. Con 32 punti contro i Milwaukee Bucks il 29 marzo, Thomas è diventato solo il sesto Celtic a segnare 2.000 punti in una sola stagione. Ha anche esteso la sua striscia con almeno un tiro da tre punti ad un franchise-best di 50 partite consecutive.
Thomas guidò i Celtics ad una vittoria al primo turno contro i Chicago Bulls dopo aver appreso il giorno prima dell’inizio della serie che sua sorella minore, Chyna Thomas, era morta in un incidente stradale fuori dalla sua nativa Tacoma, Washington. Dopo i Celtics sconfitto i Bulls 4-2, ha volato attraverso il paese per partecipare al suo funerale. Tornò a Boston per la gara 1 delle semifinali della Eastern Conference ed ebbe 33 punti e nove assist nell’aiutare i Celtics a sconfiggere i Washington Wizards 123-111. In gara 2 contro Washington, Thomas ha segnato 53 punti – il secondo totale più alto nella storia dei playoff dei Celtics – per aiutare Boston a vincere 129-119 ai supplementari e a prendere un vantaggio di 2-0 nella serie. Divenne solo il quinto Celtic a segnare 50 o più punti in una partita di postseason, mancando il record di squadra di John Havlicek per un punto. In gara 7 contro Washington, Thomas segnò 29 punti e fece 12 assist per aiutare i Celtics ad avanzare alle finali della Eastern Conference per la prima volta dal 2012 con una vittoria 115-105 e una vittoria della serie 4-3. Dopo che i Celtics hanno perso le prime due partite delle finali di Conference contro i Cleveland Cavaliers, Thomas è stato escluso per il resto della postseason con un infortunio all’anca.
Cleveland Cavaliers (2017-2018)
Il 22 agosto 2017, Thomas fu scambiato, insieme a Jae Crowder, Ante Žižić, e la scelta del primo giro del draft 2018 non protetta dei Brooklyn Nets, con i Cleveland Cavaliers in cambio di Kyrie Irving. Tuttavia, durante l’esame fisico post-trade da parte dello staff di Cleveland, sono state sollevate preoccupazioni sulla salute dell’anca precedentemente infortunata di Thomas. Di conseguenza, otto giorni dopo l’annuncio dell’affare, i Celtics hanno accettato di inviare ai Cavaliers una scelta di secondo giro del draft 2020 tramite i Miami Heat per completare il commercio. È stato poi riferito che Thomas aveva giocato con una serie di problemi secondari nella sua anca, come una perdita di cartilagine e una certa artrite, per diverse stagioni. Il 25 settembre 2017, i Cavaliers hanno detto che Thomas potrebbe giocare entro la fine dell’anno. Il 21 dicembre 2017, Thomas fece uno scrimmage con i Canton Charge della NBA G League e si vestì per la prima volta da quando si unì ai Cavaliers, vestendosi ma non giocando contro i Chicago Bulls. Il 2 gennaio 2018, Thomas fece il suo tanto atteso debutto per i Cavaliers, segnando 17 punti in 19 minuti dalla panchina in una vittoria 127-110 sui Portland Trail Blazers. Un giorno dopo, Thomas tornò al TD Garden. Anche se non ha giocato nella perdita 102-88 dei Cavaliers contro i Celtics, Thomas ha ricevuto una standing ovation dai tifosi dei Celtics. Il 6 gennaio, ebbe 19 punti e quattro assist nella sua seconda apparizione e prima partenza della stagione in una vittoria 131-127 contro gli Orlando Magic. Il 20 gennaio, segnò un season-high di 24 punti in una sconfitta 148-124 contro gli Oklahoma City Thunder.
Los Angeles Lakers (2018)
L’8 febbraio 2018, i Cavaliers scambiarono Thomas, Channing Frye e una scelta del primo giro del draft 2018 ai Los Angeles Lakers in cambio di Jordan Clarkson e Larry Nance Jr. Nel suo debutto per i Lakers due giorni dopo, Thomas ha segnato 22 punti dalla panchina in una sconfitta 130-123 contro i Dallas Mavericks. Il 1º marzo segnò un season-high di 29 punti in una vittoria 131-113 contro i Miami Heat. Il 29 marzo, è stato escluso per il resto della stagione dopo aver subito un intervento chirurgico artroscopico all’anca destra.
Denver Nuggets (2018-2019)
Il 16 luglio 2018, Thomas ha firmato un accordo di un anno con i Denver Nuggets. Ha fatto il suo debutto per i Nuggets il 13 febbraio 2019, segnando tutti e otto i suoi punti nel terzo quarto della vittoria di Denver 120-118 sui Sacramento Kings. Fu la sua prima partita dal 22 marzo 2018, quando era con i Lakers.
Washington Wizards (2019-2020)
Il 10 luglio 2019, Thomas firmò con i Washington Wizards.
Il 6 febbraio 2020, Thomas fu scambiato con i Los Angeles Clippers come acquisizione alla trade deadline. È stato rinunciato due giorni dopo.
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