Il parametro EC50 è l’abbreviazione di “mezza concentrazione massima efficace”. In un contesto farmacologico, questa può essere la concentrazione di un farmaco che è necessaria per causare la metà del massimo effetto possibile. In un esperimento di legame, l’EC50 è la concentrazione del ligando (vedi Concentrazioni) alla quale la metà del Target è presente nello stato legato.
Sia l’EC50 che il Kd servono a quantificare le interazioni e per esempio a confrontare l’Affinità di legame di diversi ligandi (vedi Ligando). Nel contesto delle misurazioni TRIC, utilizzando il modello Kd Fit per la valutazione dei dati si ottiene un Kd, mentre utilizzando il modello Hill si ottiene un valore EC50. Vedere i rispettivi articoli per maggiori dettagli.
Tuttavia, c’è un’importante differenza: la Kd è una proprietà fisica dell’interazione e indipendente dalla concentrazione del bersaglio. I Kd possono quindi essere generalmente confrontati tra le varie tecnologie finché le condizioni generali di interazione sono le stesse.
L’EC50, d’altra parte, per definizione, dipende sempre dalla concentrazione del bersaglio. Viene spesso misurata attraverso l’effetto che induce, per esempio nei saggi basati sulle cellule, e permette solo il confronto dei ligandi misurati nello stesso setup sperimentale. In situazioni in cui la concentrazione del bersaglio è inferiore alla Kd , Kd e EC50 avranno lo stesso valore, a condizione che l’interazione segua una stechiometria 1:1, sia non cooperativa (vedi Cooperatività) e sia determinata dalla legge dell’azione di massa. In situazioni in cui la concentrazione del bersaglio è nell’intervallo della Kd o superiore, la Kd e l’EC50 possono differire significativamente.
Esempio
Se una data interazione ha un valore Kd di 2 nM e il bersaglio è presente a una concentrazione di 2 µM, è necessaria una concentrazione del ligando di 1 µM per raggiungere uno stato in cui metà di tutte le molecole del bersaglio sono nello stato legato. Per definizione l’EC50 ammonta a 1 µM (500*Kd) in questo caso.