Séparatiste, également appelé indépendant, n’importe lequel des protestants anglais des 16e et 17e siècles qui souhaitaient se séparer de la corruption perçue de l’Église d’Angleterre et former des églises locales indépendantes. Les séparatistes étaient très influents sur le plan politique en Angleterre à l’époque du Commonwealth (1649-60), sous la direction d’Oliver Cromwell, le Lord Protecteur, qui était lui-même séparatiste. Par la suite, ils ont survécu à la répression et sont progressivement devenus une importante minorité religieuse en Angleterre.
Une croyance fondamentale des Séparatistes était l’idée de « l’église rassemblée » fondée par le Saint-Esprit, et non par l’homme ou l’État. Croyant que les vrais croyants chrétiens devaient chercher d’autres chrétiens et former ensemble leurs églises, les séparatistes soulignaient le droit et la responsabilité de chaque congrégation de déterminer ses propres affaires, sans avoir à soumettre ces décisions au jugement d’une autorité humaine supérieure. Cette notion contrastait avec la base territoriale de l’Église d’Angleterre, dans laquelle toute personne d’une certaine région était assignée à l’église paroissiale, et chaque paroisse locale se soumettait à la surveillance de la hiérarchie ecclésiastique plus large.
Le mouvement séparatiste était initialement illégal en Angleterre, et nombre de ses adhérents ont été persécutés par l’État et son Église. Souvent qualifiés de traîtres, de nombreux séparatistes ont fui l’Angleterre pour des pays plus tolérants. L’un de ces groupes a quitté l’Angleterre pour la Hollande en 1608 et, en 1620, certains d’entre eux, les Pèlerins, se sont installés à Plymouth, dans le Massachusetts. Les séparatistes de Plymouth ont coopéré avec les puritains qui ont établi la colonie de la Baie du Massachusetts en 1630. Bien que les puritains aient espéré à l’origine purifier et réformer l’Église d’Angleterre, ils ont accepté en Nouvelle-Angleterre la forme congrégationnelle de gouvernement de l’Église établie par les Pèlerins. Ainsi, les églises des séparatistes et des puritains sont devenues les congrégationalistes des États-Unis.