Dans sa première saison, Manning était le starter universitaire au poste de quarterback, brillant pour ses débuts et menant Newman à une victoire de 26 points. « Il n’a pas l’air d’un débutant. Cette maturité et la façon dont vous gérez ces moments difficiles, c’est là que la grandeur peut venir », a déclaré son entraîneur après coup. Plus tard, en octobre de sa saison de première année, Archie Manning a déclaré qu’Arch était devant ses oncles Peyton et Eli au même âge.
Manning a terminé sa saison de première année avec 2 407 yards et 34 touchdowns, ce qui lui a valu les honneurs de MaxPreps National Freshman of the Year, rejoignant les futurs joueurs de la NFL Jabrill Peppers et Nick Bosa, ainsi que le quarterback de Clemson Trevor Lawrence.
Manning a bénéficié d’une poussée de croissance vers la dixième année. En tant que sophomore, Manning a ouvert la saison en lançant pour six touchdowns.
Le 15 octobre 2020, Manning a fait ses débuts à la télévision nationale dans un match contre Booker T. Washington. Il a lancé pour deux touchdowns et a couru pour deux autres scores.
Pour éviter une frénésie médiatique, la famille de Manning l’a empêché de donner des interviews aux médias et a également refusé des offres prématurées de bourses universitaires. « Ils ont tout fermé », a déclaré un membre des médias locaux, « mais l’attention va venir. »
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