Ranskan hyökkäys Espanjaan vuonna 1808 aiheutti lojaalisuuden purkauksen kuningasta ja maata kohtaan ja herätti suurta huolta kirkossa. Syvä granadalainen ahdistus valtakunnan kohtalosta ja ristiriitaiset toimintatavat, joita siirtomaiden ja niemimaan alamaiset yrittivät toteuttaa hallinnon valvonnasta Espanjan kuninkaan Ferdinand VII:n vankeuden aikana, johtivat levottomuuksiin Uudessa Granadassa ja itsenäisyysjulistuksiin. Vuonna 1810 Uuden Granadan alaiset hallintoalueet erottivat espanjalaiset virkamiehet, lukuun ottamatta Santa Martan, Ríohachan ja nykyisen Panaman ja Ecuadorin alueita. Bogotassa 20. heinäkuuta 1810 tapahtunutta kansannousua muistetaan Kolumbiassa itsenäisyyspäivänä, vaikka nämä uudet hallitukset vannoivat uskollisuutta Ferdinand VII:lle ja alkoivat julistaa itsenäisyyttä vasta vuonna 1811. Idealistit ja kunnianhimoiset maakuntien johtajat halusivat liittovaltiota. Kreolijohtajat pyrkivät keskittämään uusien hallitusten vallan. Tästä seurasi sarja sisällissotia, jotka helpottivat Espanjan takaisinvaltausta Uuden Granadan yhdistyneissä maakunnissa vuosina 1814-1816. Tasavaltalaisjoukkojen jäänne pakeni Casanaren llanosiin, jossa ne järjestäytyivät uudelleen Francisco de Paula Santanderin johdolla, kolumbialaisen kenraalin, joka pysyi merkittävänä hahmona granadilaisessa politiikassa kuolemaansa asti vuonna 1840.
Mahdollinen jäljellä oleva lojaalisuus kruunua kohtaan vieraantui eurooppalaisten ja partisaanijoukkojen rangaistavasta mielivaltaisesta käytöksestä, ja niiden toimet antoivat oikeutuksen hyökkäykselle espanjalaista sivilisaatiota vastaan, joka alkoi loppuvuonna 1810 ja jatkui läpi 1800-luvun. Casanaren kapinallisjoukot liittyivät Simón Bolívarin joukkoihin Venezuelan Orinocon altaassa. Vuoteen 1819 mennessä järjestelyt säännöllistä hallitusta varten saatiin päätökseen, ja Angosturassa (nykyisessä Ciudad Bolívarissa, Venezuelassa) kokoontui perustuslakikokous, johon osallistui edustajia Casanaresta ja joistakin Venezuelan maakunnista. Samana vuonna Bolívar hyökkäsi Kolumbiaan ja kukisti espanjalaiset joukot ratkaisevasti 7. elokuuta Boyacássa. Tämän jälkeen käytiin ratkaiseva taistelu Carabobossa Venezuelassa vuonna 1821 ja Pichinchassa Ecuadorissa vuonna 1822. Sotatoimet saatiin päätökseen vuonna 1823, kun Bolívar johti joukkonsa Peruun.
Angosturan kongressi loi pohjan Kolumbian tasavallan muodostamiselle (1819-30), joka tunnettiin yleisesti nimellä Gran Colombia, koska siihen kuuluivat nykyiset erilliset Kolumbian, Panaman, Venezuelan ja Ecuadorin maat. Tasavalta järjestäytyi lopullisesti Cúcutan kongressissa vuonna 1821. Sitä ennen hallitus oli hyvin sotilaallinen ja hierarkkisesti organisoitu, ja alueelliset varapresidentit käyttivät suoraa valtaa presidentin Bolívarin ollessa kampanjoimassa. Keskitetyksi edustukselliseksi hallitukseksi organisoitu tasavalta säilytti Bolívarin presidenttinä ja vt. presidentti Santanderin varapresidenttinä.
Encyclopædia Britannica, Inc.
Gran Kolumbia eli lyhyen aikaa viriävästi sodan aikana. Sen jälkeinen siviili- ja sotilaskilpailu julkisista viroista ja alueelliset mustasukkaisuudet johtivat vuonna 1826 kenraali José Antonio Páezin johtamaan kapinaan Venezuelassa. Bolívar palasi Perusta palatakseen palauttamaan yhtenäisyyden, mutta sai aikaan vain hänen henkilökohtaisen auktoriteettinsa tunnustamisen. Kun tyytymättömyys levisi, kävi selväksi, ettei mikään ryhmä rakastanut tasavaltaa tarpeeksi taistellakseen sen olemassaolon puolesta. Vuoteen 1829 mennessä Bolívar oli jakanut maan neljään hallintoalueeseen venezuelalaisten kenraalien alaisuudessa, joilla oli siviili- ja sotilasvaltaa. Sillä välin Ocañan konventti ei ollut onnistunut järjestämään tasavaltaa uudelleen, eikä Bolívarin lyhyt diktatuuri (1828-30) menestynyt sen paremmin. Tämän jälkeen Bolívar kutsui koolle vuoden 1830 valmistelukunnan, jonka tuloksena syntyi perustuslaki, jota kunnioitettiin vain Uudessa Granadassa (nimi viittasi tuolloin vain Kolumbiaan, johon kuului Panaman kannas). Konventin aikana Bolívar erosi ja lähti pohjoisrannikolle, jossa hän kuoli Santa Martan lähellä 17. joulukuuta 1830. Siihen mennessä Venezuela ja Ecuador olivat irtautuneet Gran Kolumbiasta. Uusi Granada, vuonna 1835 1,5 miljoonan asukkaan maa, jäi omilleen.
Robert Louis Gilmore