EC50

Parametri EC50 on lyhenne sanoista ”puoliksi maksimaalinen tehokas pitoisuus”. Farmakologisessa kontekstissa tämä voi tarkoittaa lääkkeen pitoisuutta, joka tarvitaan aiheuttamaan puolet suurimmasta mahdollisesta vaikutuksesta. Sitoutumiskokeessa EC50 on se ligandikonsentraatio (ks. Konsentraatiot), jossa puolet kohdeaineesta on sitoutuneessa tilassa.

Kumpikin EC50 ja Kd palvelevat vuorovaikutusten kvantifiointia ja esimerkiksi eri ligandien (ks. Ligandi) sitoutumisaffiniteetin vertailua. TRIC-mittausten yhteydessä Kd Fit -mallin käyttäminen datan arvioinnissa tuottaa Kd-arvon, kun taas Hill-mallin käyttäminen tuottaa EC50-arvon. Katso lisätietoja vastaavista artikkeleista.

On kuitenkin yksi tärkeä ero: Kd on vuorovaikutuksen fysikaalinen ominaisuus ja riippumaton kohdepitoisuudesta. Kd:tä voidaan siksi yleensä verrata eri tekniikoiden välillä, kunhan yleiset vuorovaikutusolosuhteet ovat samat.

Ec50-arvo sen sijaan riippuu määritelmän mukaan aina kohdepitoisuudesta. Se mitataan usein sen aiheuttaman vaikutuksen kautta, esimerkiksi solupohjaisissa määrityksissä, ja sen avulla voidaan verrata vain samassa koejärjestelyssä mitattuja ligandeja. Tilanteissa, joissa kohdepitoisuus on pienempi kuin Kd , Kd:llä ja EC50:llä on sama arvo edellyttäen, että vuorovaikutus noudattaa 1:1 stoikiometriaa, on ei-kooperatiivinen (ks. Cooperatiivisuus) ja määräytyy massavaikutuksen lain mukaan. Tilanteissa, joissa kohteen konsentraatio on Kd:n alueella tai sen yläpuolella, Kd ja EC50 voivat poiketa merkittävästi toisistaan.

Esimerkki

Jos tietyn vuorovaikutuksen Kd-arvo on 2 nM ja kohteen konsentraatio on 2 µM, ligandin konsentraatio 1 µM tarvitaan, jotta saavutetaan tila, jossa puolet kaikista kohdemolekyyleistä on sitoutuneessa tilassa. Määritelmän mukaan EC50 on tässä tapauksessa 1 µM (500*Kd).

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.