Hiukkasten reagointia agglutiniinin kanssa käytetään osoittamaan isännän nykyistä tai aiempaa kosketusta patogeenin kanssa . Patogeenin tartuttama isäntä tuottaa vasta-aineita patogeenin neutraloimiseksi. Tämän seurauksena diagnostiseen sarjaan levitetty isännän veri aiheuttaa patogeenisten hiukkasten aggregaation antigeenin ja agglutiniinin vuorovaikutuksen vuoksi. Käänteisesti agglutinaatiota voidaan käyttää myös uusien bakteerien tai solujen tunnistamiseen, joilla on tietty antigeeni, altistamalla ne seerumille, joka sisältää tunnettuja agglutiniineja.
Agglutinaatiota, jossa käytetään veren agglutiniineja, jotka tunnetaan nimellä hemagglutiniineja, käytetään diagnostisesti ihmisten veriryhmien tunnistamiseen erytrosyyttien (punasolujen) antigeenien ja agglutiniinien välisen reaktion perusteella. Ihmisen erytrosyyteissä on kaksi pääasiallista antigeenityyppiä (antigeenit A ja B), jotka ilmentyvät eri yhdistelminä, jolloin saadaan joko erytrosyyttejä, jotka ilmentävät vain antigeeniä A, antigeeniä B, antigeeniä A ja B yhdessä tai ei lainkaan antigeeniä. Kun erytrosyytit altistetaan hemagglutiniineille (anti-A- ja anti-B-vasta-aineille), antigeeni A:ta tai B:tä ilmentävät erytrosyytit hyytyvät joutuessaan kosketuksiin anti-A- ja anti-B-hemagglutiniinien kanssa. Molempia antigeenejä ilmentävät erytrosyytit hyytyvät joutuessaan kosketuksiin joko anti-A- tai anti-B-hemagglutiniinien kanssa, kun taas ne, jotka eivät ilmentä mitään antigeenia, eivät hyydy joutuessaan kosketuksiin minkään hemagglutiniinin kanssa. Tämä tekniikka toimii nopeana ja tehokkaana menetelmänä henkilön veriryhmän tunnistamiseksi, ja se on välttämätön silloin, kun verensiirto on tehtävä nopeasti menetetyn veren korvaamiseksi.