En su temporada de primer año, Manning fue el titular del equipo universitario como quarterback, brillando en su debut y llevando a Newman a una victoria de 26 puntos. «No parece un estudiante de primer año. En esa madurez y en cómo maneja esos momentos de tensión es donde puede venir la grandeza», dijo su entrenador después. Más tarde, en octubre de su temporada de primer año, Archie Manning dijo que Arch estaba por encima de los tíos Peyton y Eli a la misma edad.
Manning completó su temporada de primer año con 2.407 yardas y 34 touchdowns, ganando los honores de MaxPreps National Freshman of the Year, uniéndose a los futuros jugadores de la NFL Jabrill Peppers y Nick Bosa, y al mariscal de campo de Clemson Trevor Lawrence.
Manning disfrutó de un crecimiento acelerado de cara al décimo grado. Como estudiante de segundo año, Manning abrió la temporada lanzando para seis touchdowns.
El 15 de octubre de 2020, Manning hizo su debut en la televisión nacional en un partido contra Booker T. Washington. Lanzó para dos touchdowns y corrió para otras dos anotaciones.
Para evitar un frenesí mediático, la familia de Manning le ha ocultado las entrevistas con los medios de comunicación y también ha rechazado ofertas prematuras de becas universitarias. «Han cerrado todo», dijo un miembro de los medios locales, «pero la atención va a llegar».