1808年、フランスのスペイン侵攻は、国王と国への忠誠心を爆発させ、教会に重大な懸念を抱かせた。 スペイン王フェルディナンド7世が拘束されている間、帝国の運命に対するグラナダ人の深い不安と、統治権をめぐって植民地と半島の臣民が試みた行動の矛盾は、新グラナダの争いと独立宣言につながった。 1810年、サンタマルタ、リオハチャ、現在のパナマとエクアドルを除く新グラナダの従属自治体は、スペイン人官吏を追い出した。 1810年7月20日のボゴタでの蜂起は、コロンビアでは独立記念日とされているが、これらの新政府はフェルディナンド7世に忠誠を誓い、独立宣言を始めるのは1811年になってからであった。 理想主義者や野心的な地方の指導者たちは、連邦制を望んでいた。 クレオールの指導者たちは、新政府に対する権威を集中させようとした。 1814年から1816年にかけてスペインが新グラナダ連合州を再征服した後、一連の内戦が続いた。
残された王室への忠誠心は、ヨーロッパ軍とパルチザン軍の懲罰的で勝手な行動によって疎外され、その行動は1810年後半から19世紀まで続いたスペイン文明への攻撃の正当性を与えた。 カサナレの反乱軍は、ベネズエラのオリノコ川流域にいるシモン・ボリーバルの反乱軍と合流した。 1819年には正政府の準備が整い、アンゴスチュラ（現在のベネズエラ・シウダー・ボリバル）で、カサナーレとベネズエラのいくつかの地方からの代表を集めて憲法制定会議が開かれた。 同年、ボリーバルはコロンビアに侵攻し、8月7日、ボヤカでスペイン軍を決定的なまでに打ち負かした。 その後、1821年にベネズエラのカラボボの戦い、1822年にエクアドルのピチンチャの戦いで決定的な勝利を収めた。
アンゴスツラ会議は、現在のコロンビア、パナマ、ベネズエラ、エクアドルを含むコロンビア共和国（1819-30）の成立の基礎を築いた。 1821年、ククタの議会で共和国が確定的に組織された。 それ以前は、大統領ボリーバルが選挙運動をしている間、地方の副大統領が直接権力を行使するという、高度に軍事的で階層的な政府であった。 中央集権的な代表制政府として組織された共和国は、ボリーバルを大統領に、サンタンデール大統領代理を副大統領に維持した。
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戦争中グランコロンビアには短い期間、活力が存在しました。 その後、公職をめぐる文民・軍人の対立や地域の嫉妬から、1826年にベネズエラでホセ・アントニオ・パエス将軍が反乱を起こします。 ボリーバルはペルーから帰国し、統一を回復しようとしたが、彼の個人的な権威を認めることだけを確保した。 不満が広がると、共和国の存続のために戦うほど共和国を愛している集団はないことが明らかになった。 1829年、ボリーバルは国土を4つの地域に分割し、ベネズエラの将軍が市民権、軍事権を持つようにしました。 一方、オカーニャの大会は共和国の再編成に失敗し、ボリーバルの短い独裁政権（1828-30）もこれ以上の成果を上げることができなかった。 ボリーバルは、1830年大会を招集し、ニューグラナダ（当時はパナマ地峡を含むコロンビアのみを指す名称）でのみ尊重される憲法を制定した。 ボリーバルはこの会議の途中で辞任し、北海岸に向かい、1830年12月17日、サンタマルタの近くで死去した。 その頃、ベネズエラとエクアドルはグラン・コロンビアから分離独立していた。 1835年、人口150万人の新グラナダは独立した。