1901年に乾ドックとして操業を開始し、1993年の基地再編・閉鎖委員会の勧告により1996年に操業を停止するまで海軍の施設として存続していた。
当初は海軍工廠として、後に海軍基地として指定され、地元コミュニティ、3郡地域、サウスカロライナ州全体に大きな影響を及ぼした。
1931年にエリコット・ドレッジは20インチのカッター・ドレッジ・オリオンを納入し、今でも旧チャールストン海軍造船所で稼働中であった。
この造船所で建造された最大の船は、USS Tidewater（AD-31）とUSS Bryce Canyon（AD-36）という2隻の駆逐艦テンダーであった。 これらの船のキールは、それぞれ1944年11月と1945年7月に敷設された。 8487>
戦後、造船所は拿捕したドイツ潜水艦の修理と改造を担当した。 1948年4月、ジョン・L・サリバン海軍長官はチャールストンのリヴァース下院議員とバーネット・R・メイバンク上院議員に、海軍はCNSYを潜水艦のオーバーホールヤードにする計画で、バッテリー充電装置のための初期予算計上を要請する予定であることを告げた。
1941年のチャールストン海軍工廠の航空写真。
最初の潜水艦USSコンガー（SS-477）がオーバーホールのために1948年8月に着任した。 1950年6月、北朝鮮が韓国に侵攻すると、再び生産が増加しました。 1951年には8,000人を超える従業員を抱えるまでに回復した。
潜水艦はミサイルとともに1960年代まで製造され続け、1962年にはUSSスコーピオン（SSN-589）を含む原子力潜水艦の分解修理が行われた。 1966年には原子力潜水艦USSスキップジャック（SSN-585）の初の給油を完了し、艦隊弾道ミサイル（FBM）型潜水艦USSトーマス・A・エジソン（SSBN-610）の初のオーバーホールを開始した。 ソナーを装備した巨大なFBM潜水艦や駆逐艦を扱えるよう、ドライドックNo.2の深化作業を開始した。”
この施設は、冷戦の終結とその後のBRAC委員会の措置により1990年代に閉鎖されるまで、アメリカ大西洋艦隊の多数の巡洋艦、駆逐艦、攻撃型潜水艦、FBM潜水艦、駆逐艦テンダー、潜水艦テンダーが母港として使用する主要施設であった
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