1995-ben Helton beiratkozott a Duke Egyetemre, és a Duke Blue Devils futballcsapatának diplomás asszisztense lett Fred Goldsmith irányítása alatt. Heltont később, 1996-ban futóedzővé léptették elő.
Helton 1997-ben csatlakozott édesapjához a Houstonban futóedzőként, és 1999-ig, Kim Helton utolsó vezetőedzői szezonjáig maradt ebben a pozícióban.
A Houston elhagyása után Helton csatlakozott Rip Scherer stábjához a Memphisben szintén futóedzőként. Helton az új edző, Tommy West stábjában maradt, aki 2001-ben váltotta Scherer-t. 2003-ban a wide receiverek edzőjeként tevékenykedett. 2007-re Helton előléptették támadó koordinátorrá és irányítók edzőjévé. Helton olyan játékosokat edzett a Memphisben, mint DeAngelo Williams, aki 2005-ben az NFL első körös válogatottja volt, és a 2006-os Conference USA All-Freshman választása, Duke Calhoun.
Heltont 2010-ben Lane Kiffin irányító edzőnek szerződtette a USC. 2013-ban támadó koordinátorrá léptették elő. Helton volt a csapat ideiglenes vezetőedzője a bowl-meccs alatt, miután az előző ideiglenes vezetőedző, Ed Orgeron lemondott Steve Sarkisian szerződtetése után. 2015. október 11-én ismét ő lett a Trojans ideiglenes vezetőedzője, miután Steve Sarkisian vezetőedző szabadságra ment, majd ezt követően kirúgták. 2015. november 30-án a USC eltávolította az ideiglenes jelzőt, és Heltont nevezte ki állandó vezetőedzőnek. Miután Heltont kinevezték állandó vezetőedzőnek, a USC elveszítette a 2015-ös szezon utolsó két mérkőzését a Stanford ellen a Pac-12 bajnoki mérkőzésen és a Wisconsin ellen a Holiday Bowlban. Helton első teljes szezonjában vezetőedzőként a USC 1-3-ra kezdett az Alabama, a Stanford és a Utah elleni vereségekkel, de aztán megnyerte a 2016-os alapszakasz utolsó 8 mérkőzését, valamint a Rose Bowl-t a Penn State ellen, és 10-3-as mérleggel és az AP szavazás harmadik helyével zárta a szezont.