1901-ben kezdte meg működését szárazdokkként, és a haditengerészet létesítménye volt egészen 1996-ig, amikor az 1993-as Bázisátalakítási és Bezárási Bizottság ajánlásainak eredményeként megszüntette működését. Ekkor a Detyens Shipyards, Inc. vette bérbe.
Eredetileg haditengerészeti hajógyárként, később haditengerészeti bázisként jelölték meg, és nagy hatással volt a helyi közösségre, a három megye területére és egész Dél-Karolina államra.
A hajógyár először a USS Tillman (DD-135) rombolót gyártotta, majd az 1930-as években növelni kezdte a termelést. Összesen 21 rombolót szereltek össze a haditengerészeti létesítményben.
1931-ben az Ellicott Dredges leszállította a még mindig a régi Charleston Naval Shipyardon működő 20 hüvelykes vágókotró Oriont.
A hajógyárban valaha épített két legnagyobb hajó a két romboló tendert, a USS Tidewater (AD-31) és a USS Bryce Canyon (AD-36) volt. Ezeknek a hajóknak a köleit 1944 novemberében, illetve 1945 júliusában rakták le. A 25 948 fős foglalkoztatási csúcsot 1943 júliusában érték el.
A háború után a hajógyár volt felelős a fogságba esett német tengeralattjárók javításáért és átalakításáért. 1948 áprilisában John L. Sullivan haditengerészeti miniszter közölte Charleston Rivers képviselőjével és Burnet R. Maybank szenátorral, hogy a haditengerészet azt tervezi, hogy a CNSY tengeralattjáró-felújító hajógyár lesz, és kérni fogja a kezdeti előirányzatot egy akkumulátor-töltő egységre.
Az első tengeralattjáró, a USS Conger (SS-477) 1948 augusztusában érkezett meg nagyjavításra. A hajógyár az év során mintegy 132 hajó felújítására számított, és a munkaerő létszáma közel 5000 főben stabilizálódott.
1950 júniusában Észak-Korea dél-koreai inváziója ismét megnövelte a termelést. A hajógyár 1951-re ismét több mint 8000 alkalmazottat foglalkoztatott. Összesen negyvennégy hajót aktivált a hajógyár, és huszonhetet alakított át aktív flottaszolgálatra a koreai háború alatt.
A tengeralattjárók építése a rakétákkal együtt az 1960-as években is folytatódott, és atom-tengeralattjárók felújítására is sor került, köztük a USS Scorpion (SSN-589) 1962-ben. 1966-ban a hajógyár befejezte egy atom-tengeralattjáró, a USS Skipjack (SSN-585) első üzemanyag-utántöltését, és megkezdte a flotta első ballisztikus rakéta (FBM) tengeralattjárójának, a USS Thomas A. Edison (SSBN-610) nagyjavítását. Megkezdték a 2. sz. szárazdokk mélyítését, hogy az képes legyen a hatalmas FBM tengeralattjárók és a szonárral felszerelt rombolók kezelésére.”
A létesítmény az egész hidegháború alatt jelentős létesítmény maradt, mint az amerikai atlanti flotta számos cirkálójának, rombolójának, támadó tengeralattjárójának, FBM tengeralattjárójának, romboló tendereinek és tengeralattjáró tendereinek otthona, egészen az 1990-es években a hidegháború végének és az azt követő BRAC bizottsági intézkedés eredményeként történő bezárásáig.