A részecskék agglutininnel való reakciója a kórokozóval való jelenlegi vagy korábbi gazdaszervezeti érintkezés jelzésére szolgál . A kórokozóval fertőzött gazdatest antitesteket termel a kórokozó semlegesítésére. Ennek eredményeként a diagnosztikai készlethez alkalmazott gazdatest vére az antigén-agglutinin kölcsönhatás miatt a kórokozó részecskék aggregációját okozza. Megfordítva, az agglutináció használható új baktériumok vagy specifikus antigénnel rendelkező sejtek azonosítására is, ha azokat ismert agglutinineket tartalmazó szérummal exponálják.
A hemagglutinineként ismert véragglutininok felhasználásával végzett agglutinációt diagnosztikusan az emberi vércsoportok azonosítására használják az eritrocita (vörösvértest) antigének és az agglutininek közötti reakció alapján. Az emberi eritrociták két fő antigéntípust (A és B antigén) fejeznek ki különböző kombinációkban, így vagy csak A antigént, B antigént, A és B antigént együttesen, vagy egyáltalán nem fejeznek ki antigént. Amikor az eritrociták hemagglutininekkel (anti-A és anti-B antitestekkel) kerülnek kapcsolatba, az A vagy B antigént kifejező eritrociták az anti-A, illetve az anti-B hemagglutininnel való érintkezéskor megalvadnak. A mindkét antigént expresszáló eritrociták az anti-A vagy az anti-B hemagglutininnel való érintkezéskor alvadnak, míg az egyik antigént sem expresszáló erythrociták egyik hemagglutininnel való érintkezéskor sem alvadnak. Ez a technika gyors és hatékony módszer egy személy vércsoportjának azonosítására, és alapvető fontosságú, amikor vérátömlesztést kell gyorsan elvégezni az elvesztett vér pótlására.