Az amygdala több almagból áll, amelyek közvetlenül vagy közvetve valamennyi érzékszervi rendszerből bemenetet kapnak. Az emberben az interocepció és az érzelmi tudatosság szempontjából fontosak az insulával való jelentős kölcsönös kapcsolatok.
Léziós vizsgálatok bizonyítják, hogy az amygdala a félelem kondicionálásának klasszikus paradigmáját szolgálja, állatokban és emberben egyaránt. A modern idegtudomány a mechanizmusok részletes megértését ígéri az állatokban. Emberben az amygdala ritka sérülései a félelem szubjektív élményének és a mások félelemkifejezéseinek észlelési képességének elvesztésével járnak. Emellett a szociális megismerés és a döntéshozatal károsodik.
Az agyi képalkotás emberben megerősítette, hogy a félelem szubliminálisan és más nem érzelmi jelektől függetlenül is regisztrálható: így a félelem kifejezése az arcfelismeréstől függetlenül kerül feldolgozásra. A pszichiátriai rendellenességben előforduló kiemelkedő félelemélmény szükségszerűen az amygdalát vonja felelősségre. Az agyban a szerotoninszintet növelő gyógyszerek korai hatásukkal csökkentik az amygdala neuronális válaszait.