Iniciáció
Az eukarióta DNS a hisztonok nevű fehérjékhez kötődve nukleoszómáknak nevezett struktúrákat alkot. Az iniciáció során a DNS hozzáférhetővé válik a replikációs folyamatban részt vevő fehérjék és enzimek számára. Vannak meghatározott kromoszómális helyek, az úgynevezett replikációs origók, ahol a replikáció megkezdődik. Egyes eukariótákban, például az élesztőben, ezeket a helyeket az határozza meg, hogy van egy meghatározott bázispár-szekvencia, amelyhez a replikációt indító fehérjék kötődnek. Más eukariótákban, például az emberben, úgy tűnik, nincs konszenzusos szekvencia a replikációs origók számára. Ehelyett a replikációindító fehérjék azonosíthatják a nukleoszómák specifikus módosításait az origó régióban, és azokhoz kötődhetnek.
Egy bizonyos fehérje felismeri a replikációs origót, és ahhoz kötődik, majd lehetővé teszi a DNS-replikációhoz szükséges többi fehérje számára, hogy ugyanahhoz a régióhoz kötődjenek. A DNS-hez elsőként kötődő fehérjékről azt mondják, hogy “toborozzák” a többi fehérjét. A helikáz nevű enzim két példánya az eredethez toborzott fehérjék között van. Mindegyik helikáz kitekeri és szétválasztja a DNS-hélixet egyszálú DNS-re. Ahogy a DNS szétnyílik, Y alakú szerkezetek, úgynevezett replikációs villák jönnek létre. Mivel két helikáz kötődik, a replikáció origójánál két replikációs villa jön létre; ezek a replikáció előrehaladtával mindkét irányba meghosszabbodnak, és egy replikációs buborékot hoznak létre. Az eukarióta kromoszómán több replikációs origó található, ami lehetővé teszi, hogy a replikáció egyidejűleg több száz vagy ezer helyen történjen az egyes kromoszómák mentén.
