Afhængigt af, hvor alvorlig en nyresygdom er, er der en række nyreprocedurer, som et urologiteam kan anbefale, hvoraf mange kan foretages laparoskopisk for at lette genopretningen. Almindelige nyreproblemer omfatter nyresten, cyster, godartede og kræftsvulster samt defekter eller blokeringer i urinlederen, som dræner urinen fra nyrerne.
Procedurer, der anvendes til nyresten, omfatter den ikke-invasive lithotripsy, som bruger chokbølger til at bryde store sten op, så de lettere kan passere gennem urinvejene, og en operation kaldet perkutan nefrolithonomi (PCNL) til at fjerne sten, der er for store til andre behandlinger.
Laparoskopisk cysterablation er en minimalt invasiv teknik til fjernelse af nyrcyster. Laparoskopisk pyeloplasty korrigerer problemer, hvor urinlederen og nyren er forbundet.
Når en del af eller hele nyren skal fjernes på grund af sygdom eller kræft, kaldes denne procedure for en nefrektomi. Nefrektomier kan være radikale (hele nyren fjernes) eller delvise (kun tumoren fjernes), og de kan udføres ved åben kirurgi (større snit) eller laparoskopisk (minimalt invasivt, med små snit).