I sin første sæson startede Manning som quarterback og brillerede i sin debut, hvor han førte Newman til en sejr på 26 point. “Han ligner ikke en nybegynder. Den modenhed, og hvordan man håndterer de stramme øjeblikke, er der, hvor storheden kan komme,” sagde hans træner bagefter. Senere, i oktober i hans første sæson, sagde Archie Manning, at Arch var foran onklerne Peyton og Eli på samme alder.
Manning afsluttede sin første sæson med 2.407 yards og 34 touchdowns og blev kåret til MaxPreps National Freshman of the Year sammen med de kommende NFL-spillere Jabrill Peppers og Nick Bosa og Clemson-quarterback Trevor Lawrence.
Manning nød en vækstspurt på vej ind i tiende klasse. Som andenårsstuderende åbnede Manning sæsonen ved at kaste for seks touchdowns.
Den 15. oktober 2020 fik Manning sin debut på nationalt tv i en kamp mod Booker T. Washington. Han kastede for to touchdowns og løb for yderligere to scoringer.
For at undgå en mediebrænderi har Mannings familie holdt ham tilbage fra medieinterviews og har også afvist for tidlige tilbud om et college-stipendium. “De har lukket alting ned,” sagde et medlem af de lokale medier, “men opmærksomheden vil komme.”