Reaktion af partikler med agglutinin bruges til at indikere nuværende eller tidligere værtskontakt med et patogen . En vært, der er inficeret med et patogen, producerer antistoffer for at neutralisere patogenet. Som følge heraf forårsager blodet fra en vært, der påføres et diagnosesæt, aggregering af de patogene partikler på grund af interaktionen mellem antigen og agglutininin. Omvendt kan agglutination også anvendes til at identificere nye bakterier eller celler med et specifikt antigen ved at udsætte dem for serum, der indeholder kendte agglutininer.
Agglutination ved hjælp af blodagglutininer, der er kendt som hæmagglutininer, anvendes diagnostisk til at identificere blodtyper hos mennesker baseret på reaktionen mellem erytrocyt-antigener (røde blodlegemer) og agglutininer. Menneskelige erytrocytter har to hovedtyper af antigener (antigen A og B), der udtrykkes i forskellige kombinationer, så man enten får erytrocytter, der kun udtrykker antigen A, antigen B, antigen A og B sammen eller slet ikke noget antigen. Når erytrocytterne udsættes for hæmagglutininer (anti-A- og anti-B-antistoffer), koagulerer de, der udtrykker antigen A eller B, ved kontakt med hhv. anti-A- og anti-B-hæmagglutininerne. Erythrocytter, der udtrykker begge antigener, koagulerer ved kontakt med enten anti-A- eller anti-B-hæmagglutininer, mens erythrocytter, der ikke udtrykker noget antigen, ikke koagulerer ved kontakt med noget hæmagglutinin. Denne teknik er en hurtig og effektiv metode til at identificere en persons blodtype, og den er vigtig, når der hurtigt skal foretages en blodtransfusion for at genopfylde tabt blod.