Den franska invasionen av Spanien 1808 orsakade ett utbrott av lojalitet mot kungen och landet och väckte stor oro inom kyrkan. Den djupa granadinska oron över rikets öde och de motstridiga handlingsalternativ som försökts av koloniala och halvöns undersåtar om kontrollen över regeringen under den spanske kungen Ferdinand VII:s fångenskap ledde till stridigheter i Nya Granada och till självständighetsförklaringar. År 1810 kastade de underordnade jurisdiktionerna i Nya Granada ut sina spanska ämbetsmän, utom i Santa Marta, Ríohacha och det som nu är Panama och Ecuador. Upproret i Bogotá den 20 juli 1810 firas som självständighetsdagen i Colombia, även om dessa nya regeringar svor trohet till Ferdinand VII och inte började förklara sig självständiga förrän 1811. Idealister och ambitiösa provinsledare önskade federation. Kreoliska ledare försökte centralisera makten över de nya regeringarna. En rad inbördeskrig följde, vilket underlättade Spaniens återerövring av de förenade provinserna i Nya Granada mellan 1814 och 1816. En rest av de republikanska styrkorna flydde till llanos i Casanare, där de omorganiserades under Francisco de Paula Santander, en colombiansk general som förblev en framträdande person i den granadinska politiken fram till sin död 1840.
Alla kvarvarande lojalitet mot kronan alienerades av de europeiska och partisantruppernas bestraffande och godtyckliga agerande, vars handlingar gav giltighet åt den attack mot den spanska civilisationen som inleddes i slutet av 1810 och fortsatte under 1800-talet. Rebellstyrkorna i Casanare anslöt sig till Simón Bolívars styrkor i Orinokobäckenet i Venezuela. År 1819 var arrangemangen för en reguljär regering klara, och ett konstitutionellt konvent sammanträdde i Angostura (nu Ciudad Bolívar, Venezuela) med delegater från Casanare och några venezuelanska provinser. Samma år invaderade Bolívar Colombia och besegrade på ett avgörande sätt de spanska styrkorna den 7 augusti vid Boyacá. Därefter följde det avgörande slaget vid Carabobo i Venezuela 1821 och slaget vid Pichincha i Ecuador 1822. Moppingoperationer avslutades 1823, medan Bolívar ledde sina styrkor vidare till Peru.
Kongressen i Angostura lade grunden för bildandet av Republiken Colombia (1819-30), som allmänt kallades Gran Colombia eftersom den omfattade det som nu är de separata länderna Colombia, Panama, Venezuela och Ecuador. Republiken organiserades slutgiltigt av kongressen i Cúcuta 1821. Innan dess var regeringen mycket militär och hierarkiskt organiserad, med regionala vicepresidenter som utövade direkt makt medan presidenten, Bolívar, gjorde kampanj. Republiken organiserades som en centraliserad representativ regering och behöll Bolívar som president och den tillförordnade presidenten Santander som vicepresident.
Encyclopædia Britannica, Inc.
Gran Colombia hade en kort, viril tillvaro under kriget. Efterföljande civil och militär rivalitet om offentliga ämbeten och regional avundsjuka ledde 1826 till ett uppror i Venezuela under ledning av general José Antonio Páez. Bolívar återvände från Peru för att återupprätta enigheten men fick endast ett erkännande av sin personliga auktoritet. När missnöjet spred sig stod det klart att ingen grupp älskade republiken tillräckligt mycket för att kämpa för dess existens. År 1829 hade Bolívar delat upp landet i fyra jurisdiktioner under venezuelanska generaler med civil och militär auktoritet. Under tiden hade konventet i Ocaña misslyckats med att omorganisera republiken, och Bolívars korta diktatur (1828-30) hade inte bättre framgång. Bolívar sammankallade då konventet 1830, som gav upphov till en författning som endast hedrades i Nya Granada (namnet som då endast syftade på Colombia, med Isthmus of Panama). Under detta konvent avgick Bolívar och reste till den norra kusten, där han dog nära Santa Marta den 17 december 1830. Vid den tiden hade Venezuela och Ecuador avskiljt sig från Gran Colombia. Nya Granada, ett land med 1,5 miljoner invånare 1835, lämnades ensam.
Robert Louis Gilmore