Amygdala består av flera subkärnor som direkt eller indirekt tar emot information från alla sensoriska system. Viktiga ömsesidiga förbindelser med insula är relevanta för interoception och känslomässig medvetenhet hos människan.
Lesionstudier visar att amygdala understödjer det klassiska paradigmet för konditionering av rädsla, hos djur och människa. Modern neurovetenskap lovar en detaljerad förståelse av mekanismerna hos djur. Hos människan är sällsynta skador på amygdala förknippade med en förlust av både den subjektiva upplevelsen av rädsla och förmågan att upptäcka andras uttryck för rädsla. Dessutom försämras den sociala kognitionen och beslutsfattandet.
Hjärnavbildning hos människor har bekräftat att rädsla kan registreras subliminalt och oberoende av andra icke-emotionella signaler: ett räddhetsuttryck bearbetas alltså oberoende av ansiktsigenkänning. Framträdande räddhetsupplevelser i samband med en psykiatrisk störning involverar nödvändigtvis amygdala. Läkemedel som ökar serotoninet i hjärnan har tidig verkan genom att minska neuronala reaktioner i amygdala.