Neotenia a fost observată la multe alte specii. Este important să se observe diferența dintre neotenia parțială și neotenia completă atunci când se analizează alte specii, pentru a distinge între trăsăturile juvenile care sunt avantajoase pe termen scurt și trăsăturile care sunt benefice pe tot parcursul vieții organismului; acest lucru ar putea oferi o perspectivă asupra cauzei neoteniei la o specie. Neotenia parțială constă în păstrarea formei larvare dincolo de vârsta obișnuită de maturizare, cu o posibilă dezvoltare sexuală (progenie) și o eventuală maturizare în forma adultă; acest lucru este întâlnit la Lithobates clamitans. Neotenia completă este întâlnită la Ambystoma mexicanum și la unele populații de Ambystoma tigrinum, care rămân în formă larvară pe tot parcursul vieții. Lithobates clamitans este parțial neotenoasă; aceasta întârzie maturizarea în timpul sezonului de iarnă, deoarece sunt disponibile mai puține resurse și poate găsi mai ușor resursele existente în forma larvară. Acest lucru înglobează ambele cauze principale ale neoteniei; energia necesară pentru a supraviețui în timpul iernii ca adult nou format este prea mare, astfel încât organismul prezintă caracteristici neotene până când poate supraviețui mai bine ca adult. Ambystoma tigrinum își păstrează neotenia dintr-un motiv similar; cu toate acestea, reținerea este permanentă din cauza lipsei de resurse disponibile pe tot parcursul vieții sale. Acesta este un alt exemplu de cauză de mediu a neoteniei. Mai multe specii de păsări, cum ar fi manacinii Chiroxiphia linearis și Chiroxiphia caudata, prezintă o neotenie parțială. Masculii ambelor specii își păstrează penajul juvenil până la vârsta adultă, pierzându-l la maturitate. La unele specii de păsări, păstrarea penajului juvenil este legată de perioada de mută a fiecărei specii. Pentru a se asigura că nu există o suprapunere între perioada de muiere și cea de împerechere, păsările pot prezenta o neotenie parțială a penajului; masculii nu dobândesc penajul lor strălucitor de adult înainte ca femelele să fie pregătite să se împerecheze. Neotenia este prezentă deoarece nu este nevoie ca masculii să se transforme mai devreme, iar încercarea de a se împerechea cu femelele imature ar fi ineficientă din punct de vedere energetic.
Neotenia este frecvent întâlnită la insectele care nu zboară, cum ar fi femelele din ordinul Strepsiptera. Lipsa zborului la insecte a evoluat separat de mai multe ori; factorii care ar fi putut contribui la evoluția separată a lipsei zborului sunt altitudinea mare, izolarea geografică (insule) și temperaturile scăzute. În aceste condiții de mediu, dispersia ar fi dezavantajoasă; căldura se pierde mai repede prin aripi în climatele mai reci. Femelele anumitor grupuri de insecte devin mature din punct de vedere sexual fără metamorfoză, iar unele nu dezvoltă aripi. Lipsa zborului la unele insecte femele a fost legată de o fecunditate mai mare. Afidele sunt un exemplu de insecte care este posibil să nu-și dezvolte niciodată aripile, în funcție de mediul în care trăiesc. Dacă resursele sunt abundente pe o plantă gazdă, nu este nevoie să le crească aripi și să se disperseze. Dacă resursele se diminuează, puii lor pot dezvolta aripi pentru a se dispersa pe alte plante gazdă.
Două medii care favorizează neotenia sunt altitudinile mari și temperaturile scăzute, deoarece indivizii neoteni au o fitness mai mare decât indivizii care se metamorfozează într-o formă adultă. Energia necesară pentru metamorfoză scade din fitness-ul individual, iar indivizii neoteni pot utiliza mai ușor resursele disponibile. Această tendință este observată într-o comparație a speciilor de salamandre la altitudini mai mici și mai mari; într-un mediu rece, la altitudini mari, indivizii neoteni supraviețuiesc mai mult și sunt mai fertili decât cei care se metamorfozează în formă adultă. Insectele din mediile mai reci tind să prezinte neotenie în zbor, deoarece aripile au o suprafață mare și pierd rapid căldura; este dezavantajos pentru insecte să se metamorfozeze în adulți.
Multe specii de salamandre, și amfibieni în general, prezintă neotenie de mediu. Axolotl și olm sunt specii de salamandre care își păstrează forma acvatică juvenilă pe tot parcursul vieții adulte, exemple de neotenie completă. Branhiile sunt o caracteristică juvenilă comună la amfibienii care sunt păstrate după maturizare; exemple sunt salamandra tigru și tritonul cu pielea aspră, ambele păstrând branhiile până la vârsta adultă.
Bonobii au multe caracteristici fizice în comun cu oamenii, inclusiv craniul neotenoid. Forma craniului lor nu se schimbă la vârsta adultă (doar crește în dimensiune), datorită dimorfismului sexual și a unei schimbări evolutive în momentul dezvoltării. Juvenilii au devenit maturi din punct de vedere sexual înainte ca trupurile lor să se fi dezvoltat complet ca adulți și, datorită unui avantaj selectiv, structura neotenică a craniului a rămas.
În unele grupuri, cum ar fi familiile de insecte Gerridae, Delphacidae și Carabidae, costurile energetice determină neotenia; multe specii din aceste familii au aripi mici, neotene sau nu au deloc. Unele specii de greieri își pierd aripile la vârsta adultă; în genul Ozopemon, masculii (considerat a fi primul exemplu de neotenie la gândaci) sunt semnificativ mai mici decât femelele din cauza consangvinizării. La termita Kalotermes flavicollis, neotenia este observată la femelele care mută.
La alte specii, cum ar fi salamandra de nord-vest (Ambystoma gracile), condițiile de mediu – altitudinea ridicată, în acest caz – provoacă neotenia. Neotenia se întâlnește, de asemenea, la câteva specii din familia crustaceelor Ischnomesidae, care trăiesc în apele adânci ale oceanelor.
.