Șantierul Naval Charleston a început să funcționeze în 1901 ca un doc uscat și a continuat ca unitate navală până în 1996, când și-a încetat activitatea ca urmare a recomandărilor Comisiei de realiniere și închidere a bazei din 1993. În acel moment a fost închiriată către Detyens Shipyards, Inc.
Desemnată inițial ca șantier naval și mai târziu ca bază navală, a avut un mare impact asupra comunității locale, a zonei celor trei comitate și a întregului stat Carolina de Sud.
Șantierul a produs mai întâi distrugătorul USS Tillman (DD-135), apoi a început să crească producția în anii 1930. Un total de 21 de distrugătoare au fost asamblate la instalația navală.
În 1931, Ellicott Dredges a livrat dragorul tăietor de 20 de inci Orion încă în funcțiune la vechiul șantier naval din Charleston.
Două dintre cele mai mari nave construite vreodată la șantier au fost două tandrețuri pentru distrugătoare, USS Tidewater (AD-31) și USS Bryce Canyon (AD-36). Chilele acestor nave au fost puse în noiembrie 1944 și, respectiv, iulie 1945. Vârful de ocupare a forței de muncă, de 25.948 de angajați, a fost atins în iulie 1943.
După război, șantierul naval a fost responsabil pentru reparațiile și modificările submarinelor germane capturate. În aprilie 1948, secretarul Marinei John L. Sullivan le-a spus reprezentantului Rivers din Charleston și senatorului Burnet R. Maybank că marina plănuia ca CNSY să devină un șantier de revizie a submarinelor și că va cere un credit inițial pentru o unitate de încărcare a bateriilor.
Primul submarin, USS Conger (SS-477), a sosit pentru revizie în august 1948. Șantierul naval se aștepta să revizuiască aproximativ 132 de nave pe parcursul anului, iar forța sa de muncă s-a stabilizat la aproape 5.000 de persoane.
Invazia nord-coreeană a Coreei de Sud în iunie 1950 a crescut din nou producția. În 1951, șantierul naval a ajuns din nou la peste 8.000 de angajați. În total, șantierul naval a activat patruzeci și patru de nave și a transformat douăzeci și șapte pentru serviciul activ al flotei în timpul Războiului din Coreea.
Submarinele au continuat să fie construite în anii 1960, împreună cu rachete, și au avut loc revizii ale submarinelor nucleare, inclusiv USS Scorpion (SSN-589) în 1962. În 1966, șantierul naval a finalizat prima realimentare cu combustibil a unui submarin nuclear, USS Skipjack (SSN-585), și a început prima revizie a unui submarin cu rachete balistice de flotă (FBM), USS Thomas A. Edison (SSBN-610). Au început lucrările de adâncire a Dock-ului uscat nr. 2, astfel încât acesta să poată face față submarinelor FBM masive și distrugătoarelor dotate cu sonar.”
Instalația a rămas o instalație majoră pe tot parcursul Războiului Rece, fiind un port de acostare pentru numeroase crucișătoare, distrugătoare, submarine de atac, submarine FBM, tandemuri de distrugătoare și tandemuri de submarine ale Flotei Atlantice a SUA până la închiderea sa în anii 1990, ca urmare a sfârșitului Războiului Rece și a acțiunii ulterioare a Comisiei BRAC.
.