Inițiere
ADN-ul eucariot este legat de proteine cunoscute sub numele de histone pentru a forma structuri numite nucleozomi. În timpul inițierii, ADN-ul este făcut accesibil proteinelor și enzimelor implicate în procesul de replicare. Există locații cromozomiale specifice, numite origini de replicare, unde începe replicarea. La unele eucariote, cum ar fi drojdia, aceste locații sunt definite prin existența unei secvențe specifice de perechi de baze la care se leagă proteinele de inițiere a replicării. La alte eucariote, cum ar fi oamenii, nu pare să existe o secvență consensuală pentru originile de replicare. În schimb, proteinele de inițiere a replicării ar putea identifica și se pot lega la modificări specifice ale nucleozomilor din regiunea originii.
Certe proteine recunosc și se leagă la originea replicării și apoi permit celorlalte proteine necesare pentru replicarea ADN-ului să se lege de aceeași regiune. Se spune că primele proteine care se leagă de ADN „recrutează” celelalte proteine. Două copii ale unei enzime numite elicază se numără printre proteinele recrutate la origine. Fiecare elicază derulează și separă helixul de ADN în ADN monocatenar. Pe măsură ce ADN-ul se deschide, se formează structuri în formă de Y numite furci de replicare. Deoarece două elicaze se leagă, la originea replicării se formează două furci de replicare; acestea se extind în ambele direcții pe măsură ce replicarea avansează, creând o bulă de replicare. Există mai multe origini de replicare pe cromozomul eucariot, ceea ce permite ca replicarea să aibă loc simultan în sute sau mii de locații de-a lungul fiecărui cromozom.