In zijn eerste jaar was Manning de varsity starter als quarterback. Hij schitterde in zijn debuut en leidde Newman naar een overwinning van 26 punten. “Hij ziet er niet uit als een eerstejaars. Die volwassenheid en hoe je omgaat met die krappe momenten zijn waar de grootsheid kan komen,” zei zijn coach na afloop. Later, in oktober van zijn eerstejaarsseizoen, zei Archie Manning dat Arch op dezelfde leeftijd voor lag op ooms Peyton en Eli.
Manning voltooide zijn eerstejaarsseizoen met 2.407 yards en 34 touchdowns, waarmee hij MaxPreps National Freshman of the Year honors verdiende, samen met toekomstige NFL-spelers Jabrill Peppers en Nick Bosa, en Clemson-quarterback Trevor Lawrence.
Manning genoot van een groeispurt richting de tiende klas. Als tweedejaars opende Manning het seizoen door voor zes touchdowns te gooien.
Op 15 oktober 2020 maakte Manning zijn debuut op de nationale televisie in een wedstrijd tegen Booker T. Washington. Hij gooide voor twee touchdowns en rushed voor een extra twee scores.
Om een media-gekte te voorkomen, heeft Manning’s familie hem geweerd van media-interviews en ook voortijdige collegebeursaanbiedingen afgewezen. “Ze hebben alles afgesloten,” zei een lid van de lokale media, “maar de aandacht gaat komen.”