Reação de partículas com a aglutinina é usada para indicar contato presente ou passado do hospedeiro com um patógeno . Um hospedeiro infectado com um agente patogénico produz anticorpos para neutralizar o agente patogénico. Como resultado, o sangue de um hospedeiro aplicado a um kit de diagnóstico causa a agregação das partículas patogénicas devido à interacção antigénio-aglutinina. Por outro lado, a aglutinação também pode ser usada para identificar novas bactérias ou células com um antígeno específico, expondo-as ao soro contendo aglutininas conhecidas.
Agglutinação, usando aglutininas sanguíneas conhecidas como hemaglutininas, é usada no diagnóstico para identificar tipos sanguíneos de seres humanos com base na reação entre os antígenos eritrócitos (glóbulos vermelhos do sangue) e as aglutininas. Os eritrócitos humanos têm dois tipos principais de antígenos (Antígeno A e Antígeno B) expressos em combinações diferentes para dar ou eritrócitos que expressam apenas o antígeno A, antígeno B, antígeno A e B juntos ou nenhum antígeno. Quando os eritrócitos são expostos a hemaglutininas (anticorpos anti-A e anti-B), aqueles que expressam o antígeno A ou B coagulam ao entrar em contato com as hemaglutininas anti-A e anti-B, respectivamente. Os eritrócitos que expressam ambos os antígenos coagulam ao entrar em contato com as hemaglutininas anti-A ou anti-B, enquanto que os que não expressam nenhum antígeno não coagulam ao entrar em contato com nenhuma hemaglutinina. Esta técnica serve como um método rápido e eficaz para identificar o tipo de sangue de uma pessoa e é essencial quando a transfusão de sangue tem que ser realizada rapidamente para repor o sangue perdido.