Iniciação
O DNA eucariótico está ligado a proteínas conhecidas como histonas para formar estruturas chamadas nucleosomas. Durante a iniciação, o DNA é tornado acessível às proteínas e enzimas envolvidas no processo de replicação. Existem localizações cromossômicas específicas chamadas origens da replicação, onde a replicação começa. Em alguns eucariotas, como as leveduras, esses locais são definidos por uma seqüência específica de pêlos-base aos quais as proteínas de iniciação da replicação se ligam. Em outros eucariotas, como os humanos, não parece haver uma sequência consensual para as suas origens de replicação. Em vez disso, as proteínas de iniciação de replicação podem identificar e se ligar a modificações específicas dos nucleossomos na região de origem.
As proteínas de certas proteínas reconhecem e se ligam à origem da replicação e então permitem que as outras proteínas necessárias para a replicação do DNA se liguem à mesma região. As primeiras proteínas que ligam o DNA são ditas para “recrutar” as outras proteínas. Duas cópias de uma enzima chamada helicase estão entre as proteínas recrutadas para a origem. Cada helicase desenrola e separa a hélice de ADN em ADN de cadeia única. À medida que o DNA se abre, estruturas em forma de Y chamadas garfos de replicação são formadas. Como duas hélicas se ligam, dois garfos de replicação são formados na origem da replicação; estes são alargados em ambas as direcções à medida que a replicação prossegue criando uma bolha de replicação. Existem múltiplas origens de replicação no cromossoma eucariótico que permitem que a replicação ocorra simultaneamente em centenas a milhares de locais ao longo de cada cromossoma.
