Panama je transkontinentální stát o rozloze 75 417 m2. km (29 119 km²) od Střední po Jižní Ameriku.
Jak lze pozorovat na fyzické mapě Panamy, krajině země dominují zalesněná pohoří sopečného původu, která se táhnou od kostarických hranic až po jihoamerickou Kolumbii. K významným pohořím patří táhlé Centrální pohoří a také pohoří San Blas, Talamanca a Tabasara.
Nejvyšším bodem Panamy je 3 475 m vysoký Volcán Barú. Polohu bodu na mapě vyznačuje žlutý vztyčený trojúhelník.
Písečné pobřeží s plážemi v Panamě přechází v zalesněné nížiny, které se zvedají do úpatí vnitrozemských horských pásem. Východní třetina Panamy (provincie Darien) je řídce osídlená země deštných lesů, řek a bažinatých nížin ohraničených vysokými horskými štíty. Darienská proláklina před hranicí s Kolumbií je nehostinná, téměř neprostupná hustá džungle.
Severní pobřeží lemují stovky malých ostrovů, které tvoří souostroví Bocas del Torro a San Blas. K významným ostrovům podél jižního pobřeží patří Perlové ostrovy (známé z filmu Trosečník), Taboga, Cebaco a Coiba. Území odvodňují stovky řek, většinou malých; mezi významné patří Charges, Chepo, Chucunague, San Pablo, Santa Maria a Tuira.