Amygdala se skládá z mnoha podjader, která přijímají vstupy přímo či nepřímo ze všech smyslových systémů. Pro interocepci a emoční uvědomování u člověka jsou důležitá významná reciproční spojení s ostrovní mozkovou kůrou.
Lesionální studie ukazují, že amygdala slouží klasickému paradigmatu podmiňování strachu, a to u zvířat i u člověka. Moderní neurověda slibuje podrobné pochopení mechanismů u zvířat. U člověka jsou vzácné léze amygdaly spojeny se ztrátou subjektivního prožívání strachu i schopnosti detekovat projevy strachu u druhých. Kromě toho dochází k narušení sociálního poznávání a rozhodování.
Zobrazování mozku u člověka potvrdilo, že strach může být registrován podprahově a nezávisle na jiných neemočních signálech: výraz strachu je tedy zpracováván nezávisle na rozpoznání obličeje. Výrazné prožívání strachu u psychiatrické poruchy nutně implikuje amygdalu. Léky, které zvyšují hladinu serotoninu v mozku, mají časné účinky na snížení neuronálních reakcí v amygdale.
.